云南栘[木衣]TCP基因家族全基因组鉴定与表达分析
简介:云南栘[木衣](Docynia delavayi(Franch.)Schneid.)作为一种经济林果树,具有较高药用和食用价值.TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating cell factor)基因家族在植物整个生长发育过程中发挥着重要的作用.为探讨云南栘[木衣]TCP基因家族在其生长发育过程中的作用,本研究利用生物信息学方法对云南栘[木衣]TCP基因家族进行了全基因组鉴定,并分析了其在种子萌发和果实发育不同时期的表达水平.结果显示,云南栘[木衣]共有18个DdeTCP基因,不均匀地分布在11条染色体上.系统进化分析结果显示,DdeTCP在Class I中有3个成员,Class Ⅱ类有15个成员,表明DdeTCP家族成员间出现了功能分化.基因表达模式分析显示,AtTCP14同源基因DdeTCP11在种子萌发前期具有较高的表达水平,表明其可能在种子萌发时期发挥重要作用.此外,聚类在Class I中的DdeTCP 16在果实成熟期表达量较高,推测其可能与果实成熟有关.本研究为进一步探索DdeTCP基因家族在云南栘[木衣]生长发育过程中的功能奠定了基础.展开
关键词:云南栘[木衣]转录组TCP基因家族生物信息学表达分析
在线出版日期:2025-03-12 (网站首发日期)