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单叶蔷薇GRAS转录因子家族鉴定及表达分析
简介:[目的]对单叶蔷薇(Rosa persica)GRAS基因家族成员进行鉴定及功能分析,为单叶蔷薇GRAS基因家族功能研究及育种应用奠定理论基础.[方法]以单叶蔷薇基因组为研究对象,对单叶蔷薇GRAS基因家族进行成员鉴定、结构分析、进化分析、顺式作用元件分析、GRAS蛋白二级结构、三级结构预测,结合转录组对组织部位、不同水平干旱和低温胁迫环境中基因表达进行分析.[结果]鉴定出42个GRAS基因家族成员,分布在7条不同的染色体上;42个RbGRAS基因可分为9个亚族;基因结构分析表明RbGRAS基因具有保守的N端,而C端在结构上较多变;对基因家族成员共线性分析显示,有4对片段重复基因和4对串联重复基因;顺式作用元件分析发现,单叶蔷薇GRAS基因家族中含有丰富的激素应答元件和胁迫响应元件;RbGRAS蛋白二级预测结构以α-螺旋以及无规则卷曲为主,三级预测结果显示蛋白组成相似;组织特异性表达分析结果显示GRAS基因主要在根系和茎组织中表达,在花中表达量较低;RbGRAS基因在干旱和低温胁迫中也存在基因特异性表达.[结论]鉴定得到42个RbGRAS家族成员,均含有逆境相关作用元件,RbGRAS27和RbGRAS41分别对干旱和低温胁迫积极响应.展开
学者:孔青洋张晓龙李娜张晨洁张雪云于超张启翔罗乐
关键词:单叶蔷薇GRAS基因家族生物信息学分析表达分析干旱胁迫低温胁迫
分类号:S511(禾谷类作物)
资助基金:国家重点研发计划;国家重点研发计划;中央高校基本科研业务费专项;国家自然科学基金;32071820
论文发表日期:
在线出版日期:2025-03-26 (网站首发日期)
页数:11(210-220)