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癌症基因组框内突变功能注释及计算方法比较分析
简介:框内突变是编码区插入缺失突变的一种常见类型,与癌症的发生发展密切相关.然而,计算方法在癌症驱动框内突变预测方面的有效性尚缺乏明确共识.首先,系统地比较和评估了 8种计算方法,证实了它们在识别癌症驱动框内突变的适用性及可靠性.然后,选用其中 4种表现优异的计算方法,进一步挖掘了癌症基因组中潜在的驱动框内突变,并探究了这些突变作为癌症驱动突变的合理性.最终,构建了一个用户访问友好、集成多种预测方法及注释信息的线上数据库dbCCID,旨在为研究人员提供便利.这些工作为癌症框内突变预测方法的选择和开发提供了理论支撑.展开
学者:刘清瑞刘婕岳振宇夏俊峰
关键词:框内突变癌症性能评估数据库构建
分类号:TP391(计算技术、计算机技术)
资助基金:国家自然科学基金
论文发表日期:
在线出版日期:2025-04-03 (网站首发日期)
页数:10(311-320)